Un test national pour diagnostiquer le covid-19 [Actu]

"Nous avons obtenu des résultats dans un temps record", dit le gros titre
en haut, sur fond bleu, un titre sur les contrepropositions
faites par les détenteurs de bons du trésor argentin
au plan gouvernemental de restructuration de la dette

Le gouvernement argentin a annoncé hier, au cours d’une conférence de presse triomphale, le développement d’un test de diagnostic du covid-19 plus rapide et moins coûteux à mettre en œuvre que le test utilisé partout jusqu’à présent.

Le nouveau test, baptisé Covid-19 ®Neokit, dont le principe n’a pas fait l’objet d’un article scientifique mais très probablement celui d’un dépôt de brevet international, devrait permettre au pays de se passer à assez court terme de l’importation de l’autre test (qui entraîne de lourdes dépenses publiques en devises étrangères et des risques de retard à la livraison, étant donné la tension qui règne dans les usines de production) et du recours aux appareils d’analyse de laboratoire, eux aussi particulièrement onéreux à l’acquisition. Les essais de validation ont été réalisés sur les ARN obtenus à partir de 85 prélèvements de patients conservés à l’Instituto Malbrán (1), qui jusqu’à présent centralisait l’administration de presque tous les tests de diagnostic pour le covid. Le procédé a systématiquement donné le bon résultat, positif pour 50 échantillons et négatifs pour les 35 autres. Ses performances seraient donc identiques à celles de son homologue. Toutefois il n’a pas encore effectué de diagnostics nouveaux.

Le gros titre porte sur les propositions des détenteurs de la dette nationale
Seule la photo principale concerne la nouvelle sanitaire
En haut, sur fond noir, la mort d'un chanteur populaire
qui était dans le coma depuis plus d'un an à la suite d'un traumatisme crânien
En bas, à droite, la photo de Gabriela Sabatini, la championne de tenis,
qui fête actuellement ses 50 ans
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Le procédé consiste à faire passer l’ARN purifié du virus infectieux isolé dans les prélèvements dans un réactif chauffé à 65° qui accélère la multiplication des segments significatifs du génome viral et passe ainsi du violet au bleu si ce génome est celui du Sars-Cov-2. Si c’est celui du virus de la grippe, dont l’épidémie australe est proche, le réactif conserve sa couleur initiale. Une simple étuve peut donc suffire à cette étape du diagnostic, l’opération la plus lourde demeurant celle de l’extraction d’ARN, après le prélèvement, qui ne change pas, nécessite toujours la même quantité d’écouvillons médicaux et reste incommode pour le patient. Le nouveau procédé présente aussi une bonne sécurité pour les manipulateurs puisque les petits tubes à essai qu’il nécessite sont hermétiquement scellés pour éviter le contact avec le contenu et peuvent être jetés après chauffage, tels quels, selon les normes en usage pour les matériaux infectés.

Le kit est produit par un consortium public-privé, Neokit SAS, qui associe le Conicet (centre national de recherche scientifique et technologique) et le laboratoire privé Pablo Cassara. Des financements publics sont encore attendus pour développer le produit comme il convient. Avant la survenue du covid, Neokit SAS travaillait sur des tests de détection de maladies endémiques comme la dengue (présente depuis longtemps dans le nord du pays) ou des affections apparues plus récemment comme le chikugunya, le zika ou la maladie de Chagas, qui a fait de gros dégâts cet été dans des provinces particulièrement pauvres. Les recherches sur le test relatif à cette dernière ont eu le temps d’aboutir mais le reste a été laissé de côté pour mobiliser toutes les énergies sur la pneumonie pandémique, déclarée priorité des priorités étant donné qu’elle est très contagieuse, passablement dangereuse, inconnue (ce qui n’est pas le cas des trois autres affections) et qu’elle met toute l’économie, qui n’en avait pas besoin, au point mort.

Le gouvernement attend de ce nouveau procédé une capacité accrue de diagnostic grâce à la maîtrise de la production et à la simplification de l’opération finale qui pourra désormais être confiée à un personnel plus nombreux parce que moins qualifié que des techniciens en biologie dans des laboratoires lourdement équipés. La couverture territoriale pourrait elle aussi en être améliorée. Un seul kit contient le matériel pour une centaine de diagnostics, en comptant de multiples diagnostics simultanés par patient.

La nouvelle n'est traitée que tout en bas, à droite
Le reste de la une est dominée par des questions économiques.
Il n'y a que l'argent qui compte !
Et on est devant la une d'un journal catholique.
Cliquez sur l'image pour une haute résolution

La nouvelle tombe bien au moment où l’Argentine (et l’ensemble du sous-continent) semble s’acheminer vers le pic épidémiologique, comme les scientifiques l’avaient annoncé fin mars (2), et où des foyers de contagion assez dangereux se sont déclarés dans plusieurs bidonvilles, dont celui de Retiro (Buenos Aires) où la plus emblématique des porte-parole de la culture prolétarienne, journaliste à la revue autogérée Garganta Poderosa, vient d’être hospitalisée.

A la fin de la semaine prochaine, on s’attend à disposer de 10.000 kits, ce qui permettrait de réaliser un million de tests (l’Argentine compte 46 millions d’habitants). A terme, on prévoit une production de 100.000 kits par semaine. De quoi couvrir assez vite une bonne partie des besoins partout dans le pays, si ces prévisions sont réalistes, et de donner aux autorités sanitaires le contrôle sur l’épidémie.

Il reste néanmoins à mettre le système à l’épreuve du terrain, avec des patients jamais diagnostiqués. Il n’y a pas de raison que ce soit une catastrophe mais la certitude de l’efficacité ne sera acquise que d’ici quelques semaines. En attendant, cette performance nationale remonte le moral de tout le monde et c’est toujours bon à prendre.

Pour aller plus loin :

lire l’article de Página/12 qui interviewe le directeur de l’équipe des développeurs du Neokit

lire l’entrefilet de La Prensa

lire l’article de Clarín

lire l’article de La Nación, dont le journaliste, la voix sensiblement étouffée par un masque, a posé la première question aux ministres hier soir lors de la conférence de presse

voir la conférence de presse gouvernementale sur le canal You Tube de la Casa Rosada

lire le communiqué officiel de la présidence.

Mise à jour du 19 mai 2020 :
lire cet article de Clarín sur le procédé mis en œuvre dans le test argentin.

(1) 85 tests de validation, ce n’est pas très lourd mais nécessité fait loi dan ce pays étranglé par sa dette et ses porteurs de bons du trésor assez mal disposés envers l’Argentine (ce qui est normal, les investisseurs privés qui prêtent à des pays comme l’Argentine sont pour la plupart des spéculateurs institutionnels ou particuliers qui ne respectent aucun principe éthique).

(2) C’est le mois de la fête nationale. Les célébrations de ce premier 25 mai du mandat, qui devait aussi rendre un hommage plus particulier à Manuel Belgrano, en cette année qui lui est consacrée, semblent bel et bien compromises, en tout cas dans leurs formes traditionnelles.